Director
Director adjunct
Direcția generală Căpitănia Portului Giurgiulești
Direcția dirijare, monitorizare trafic și control portuar
Direcția servicii de siguranță portuară
Direcția siguranța navigației interioare
Direcția înregistrări nave, reglementări tehnice și evidență a personalului navigant
Direcția juridică, cooperare internațională și comunicare
Serviciul controlul statului-port/statului-pavilion
Secția economico-financiară
Serviciul tehnologia informației și comunicațiilor
Serviciul resurse umane și managementul documentelor